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生物医药产业一直是园区重点发展的产业之一。目前有近60家内外资医药企业在园区投资，累计投资超过100亿元。去年，园区生物医药企业实现销售收入65.4亿元，出口创汇3.1亿美元，利税5.5亿元，在园区工业经济中呈现出鲜明 的特色。
西门子、礼来、碧迪等世界知名医药企业早在园区成立之初就投资园区，葛兰素-史克、卫材、百特、康宝莱、辉瑞、强生等一批全球知名医药企业目前也聚集园区。分析区内生物医药企业发展情况可以发现，早期来园区投资的医药企业普遍已进入投资回收期，企业销售、盈利逐年上升，呈现企业和地方双赢的良好局面。不少医药企业已成为国内医药行业“新主角”。据中国医药经济数据网统计，园区有5家企业名列“全国医药工业企业利润百强”。贝克曼库尔实验系统(苏州)有限公司和苏州胶囊公司分别名列全国卫生材料工业企业50强的第5位和第7位；苏州碧迪医疗器械有限公司、优利康听力技术(苏州)有限公司和西门子听力仪器(苏州)有限公司分别名列全国医疗器械工业企业50强的第6位、9位和38位。园区企业生产的部分产品如助听器、一次性输液用品、医用诊断试剂等，无论是品牌还是市场份额，在全国有着举足轻重的地位。
值得重视的是，园区生物医药产业的发展也存在一定的“内伤”，医药研发基础薄弱、创新体系的欠缺是其中之一。目前苏州医药相关的研究院所基本没有，仅有苏州大学一所重点高校担负着部分药物研发基础工作，与企业缺乏合作，研发工作与市场、企业严重脱节，成果转化慢。多数企业缺少具有自主知识产权的新产品，真正具备条件研发新药的医药企业很少，医药制造企业研发投入不足，成为园区提升医药产业竞争力的致命伤。与此同时，医药高端研发人才目前仍然高度集中在上海、北京等大城市，园区本土缺乏符合生物医药企业要求的研发人才，特别缺乏既掌握尖端生命科学技术，又精通科研企业管理，熟谙风险投资体系的创业型人才。如何利用制度创新吸引人才和项目成为园区发展生物医药的关键。
此外，体系完整的生物产业应是产学研相结合、科工贸一体化、集医药种植、生产、加工、仓储、配送和销售于一体的现代化产业体系。目前，园区生物医药企业大多是生产加工企业，缺少以产品研发为主的机构和为医药产业发展服务的咨询、中介、金融等创新服务机构的中介组织。
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